Významná prestavba sa uskutočnila už niekedy okolo roku 1335 a zrejme súvisela s prevzatím kostolíka Jakubovcami, známou richtárskou rodinou z Bratislavy. Následne bol interiér svätyne vyzdobený novými freskami. Ďalšie opravy si vyžiadal v priebehu 18.storočia kvôli škodám, ktoré vznikli počas protitureckých vojen a v dôsledku zemetrasenia.

Začiatkom 20. storočia už prestáva stredoveká stavba kapacitne postačovať potrebám veriacim a tak sa rozhodlo o stavbe nového chrámu v neorománskom slohu. Ten pristavali z južnej strany k starému kostolíku v roku 1910 tak, že zbúrali južnú stenu jeho lode.